В офисе мэра Источника на столе стоит фигурка vault-boy. Это отсылка к играм серии Fallout.
В начале игры когда нас везут на багги перед нами, на приборной панели расположена фигурка-башкотряс морпеха из игры DOOM.
В логове бандитов можно найти скрытую комнату с кубком, которая является отсылкой к игре Wolfenstein 3D.
В "гараже безбашенных" можно найти скрытую комнату с фигуркой шамблера (shambler), одного из врагов Quake. Для того, чтобы попасть в эту комнату нужно нажать на 3 кнопки в "гараже безбашенных" (кнопки выполнены в стилистике игры Quake), которые появляются в комнате после прохождения миссии и последующего возвращения в "гараж безбашенных".
В убежище машиноголовых можно найти скрытую комнату, которая активируется, если использовать семь компьютеров в одной из дальних комнат. И если пойти в самое начало уровня можно открыть скрытую дверь, попав на один из уровней DOOM'a.
На некоторых уровнях можно найти коробки карандашей Квайола (Quayola). Символ на этих коробках повторяет символ Quake.
После выполнения задания по захвату моста Правительства, в Подземке появится страж, охраняющий генератор. Если подойти к этому стражу, то он прикажет вам поднять банку с консервами. Это отсылка к игре Half-Life 2, где в самом начале игры, в Сити 17 патрульный гражданской обороны заставляет Гордона Фримена поднять и выкинуть банку в мусор.
Территория Подземки имеет сходство с территорией Гонконг из игры Deus Ex.
Возле болота, где растут невиданные цветы, живёт в хижине отшельник у него на майке спереди логотип DOOM 3.
База правительства носит название "Нексус" - это отсылка к играм Quake 2, Quake 4, Warzone 2100 и ETQW, в которых вражеский центр также носит это название.
На некоторых уровнях можно собирать кружки с эмблемой DOOM'a.
В перегонном заводе прямо перед выходом стоит стальная балка с надписью на русском - "Ян был здесь". Это отсылка к играм серии Fallout.
На крыше заправки красуется логотип компании MIXOM. Это отсылка к игре DOOM 3.
У Сиры в городе Полумесяц на аппарате нарисован кибердемон.